低降温速率冷冻制样消除蛋白质快速漂移
来源：生物物理研究所|发布时间：2021-09-08|【 】
2021年9月6日，《qrb discovery》杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所章新政课题组的研究论文"low-cooling-rate freezing in biomolecular cryo-electron microscopy for recovery of initial frames"。文章发现了在冷冻电镜成像过程中导致电子束诱导蛋白质样品快速漂移的新机制，并提出通过降低冷却速率制备无快速漂移的冷冻电镜样品的新方法。该方法可以有效恢复辐照损伤最少，含最多高分辨信号的成像数据质量，提升重构分辨率，实现辐照损伤敏感氨基酸的高分辨重构，高分辨信号的恢复也为冷冻电镜达到原子分辨率打下基础。
1980s，dubochet把含水样品快速投入到-183℃的液态乙烷中，制备包埋在玻璃态冰中的低温样品来减少生物样品受高能电子束照射产生的损伤。一般认为，降温速率越快越容易产生玻璃态冰。但是玻璃态冰中的蛋白质在电子束照射初期会产生快速漂移，无法矫正，使冷冻电镜前几帧成像模糊而无法有效的应用于三维重构。电子束曝光初期的冷冻电镜数据具有最小的辐照损伤，含有最主要的高分辨信号，所以电子束诱导的快速漂移是实现原子分辨率结构解析以及易辐照损伤氨基酸高分辨重构所需要克服的壁垒，被richard henderson在2017年的诺贝尔奖报告中称为冷冻电镜中的"key outstanding problem"。
经过近5年的攻关，我们发现快速漂移源自玻璃态冰在急速冻结时产生的应力，该应力和过高的降温速率相关，可以通过降低冷却速率来减少。通过优化冷冻制样技术，降低冷冻过程中样品的降温速率，我们最终实现了蛋白质快速漂移的消除（图1）。在降低冷却速率制备得到的冷冻样品中，我们的数据分析展示冷冻电镜前几帧数据被有效恢复，从恢复的电子密度图中我们可以清晰看到在普通冷冻样品结构中无法得到的辐照损伤敏感的氨基酸侧链信息。
中国科学院生物物理研究所章新政研究员为本文的通讯作者，章新政课题组博士生吴春玲和石会刚为文章的共同第一作者。中国科学院生物物理研究所范克龙研究员为课题提供主要样品，中国科学院生物物理研究所与中国科学技术大学联合培养博士生朱东杰也为该项成果贡献了力量。本项目得到科技部国家重点研发计划、自然基金委重点项目、中国科学院战略性先导科技专项（b类）、中国科学院基础前沿科学研究计划项目的支持。
图1. 降低样品冷却速率消除快速漂移示意图。a. 通过降低样品冷却速率，冷冻电镜前几帧数据明显恢复。b-c. 增加载网与镊子的传热在载网形成的冷却速率梯度和在不同冷却速率下gdh样品前几帧的恢复情况。d-e. 提高液态乙烷温度至-110℃时制备的铁蛋白样品，及在不同温度下铁蛋白前几帧的恢复情况。f. 冷冻电镜前几帧恢复后，易受辐照损伤的氨基酸侧链密度图对比。
文章链接：
（供稿：章新政研究组）
附件下载：
